L'estensione di file HMS è principalmente associata all'Hydrologic Modeling System (HEC-HMS), un'applicazione software sviluppata dall'Hydrologic Engineering Center del Corpo degli Ingegneri dell'Esercito degli Stati Uniti. Questo formato di file funge da file di progetto principale che coordina le varie componenti di una simulazione idrologica. Agisce come un contenitore o un sistema di puntatori che collega tra loro modelli di bacino, modelli meteorologici, specifiche di controllo e dati di serie temporali necessari per simulare i processi di precipitazione-deflusso di sistemi idrografici dendritici. Il file stesso è tipicamente un file di configurazione basato su testo che memorizza la struttura del progetto, i riferimenti a file di dati esterni e i parametri di simulazione. Ingegneri e idrologi utilizzano questi file per gestire progetti complessi di risorse idriche, come la riduzione dei danni da inondazione, l'analisi della capacità degli sfioratori dei bacini idrici e la progettazione di sistemi di drenaggio urbano. Trattandosi di un file di gestione del progetto, non contiene i risultati grezzi della simulazione, ma piuttosto le istruzioni e le impostazioni necessarie affinché il motore HEC-HMS esegua i calcoli e generi i dati di output, che vengono solitamente archiviati in file DSS (Data Storage System) separati.